研究人员发布了新的枣椰子基因组序列

纽约大学阿布扎比分校的基因组和系统生物学中心(NYUAD CGSB)和阿联酋哈里发基因工程和生物技术中心(KCGEB)的研究人员与其他机构合作，使用长读法开发了一种改进的椰枣基因组组装方法。测序技术。对当前基因组版本的改进将有助于进一步的研究，并为这种重要的中东和北非地区食物来源的繁殖实践提供信息。

此外，研究人员还鉴定了导致颜色变化的基因和突变以及枣椰子果实中主要糖的含量，包括将蔗糖分解为葡萄糖和果糖的酶转化酶的基因。这些水果颜色和糖基因的定位是通过全基因组关联研究(GWAS)进行的。GWAS已用于绘制人类重要疾病基因的图谱，这是首次将其用于枣椰树。

虽然枣椰子(Phoenix dactylifera)是世界上最早的驯化树种之一，并且仍然是北非和中东地区的主要水果作物，但几乎没有基因组资源。再加上较长的世代，使得该多年生物种的进化基因组研究受到限制。在发表于《自然通讯》杂志上的《枣椰果性状全基因组关联图谱》中，研究人员报告说，他们为枣椰树生产了改良的基因组装配，比现有的基因组装配大了18%，并且更加连续。这个长期阅读的基因组序列大会，加上进入阿拉伯联合酋长国的两个大型，成熟的枣椰子园，使他们能够对该物种进行全基因组关联映射。结果，他们成功地绘制了先前确定的性别确定基因座和水果颜色和糖水平多态性基因。

纽约大学首席科学家兼生物学银教授，纽约大学阿布扎比基因组和系统生物学中心的一部分，迈克尔·普鲁加南(Michael Purugganan)评论说：“由于未来我们在粮食安全方面面临挑战，我们将需要继续研究诸如椰枣之类的农作物可以帮助我们在全球范围内提供粮食安全的努力我们在扩大椰枣基因组方面的进展终于揭示了一些秘密，这些秘密解释了这种树种如何在各种挑战中不断蓬勃发展生态系统。”

该果树中的枣椰子基因组测序和首个GWAS定位是由NYUAD和KCGEB领导的一项国际努力，并且还包括美国，瑞士，法国，英国，沙特阿拉伯和墨西哥的研究人员。